A história do animes começa começa com Yugi Muto, que é um garoto tímido, baixo e introvertido que estuda no ensino médio e passa boa parte do tempo na loja de jogos do seu avô. Diferente de outros jovens, ele não se destaca fisicamente nem socialmente, mas tem uma grande paixão por jogos e quebra-cabeças. Seu maior desafio é montar o Puzzle do Milênio, um artefato egípcio antigo composto por várias peças difíceis de encaixar. Depois de muito esforço, Yugi finalmente completa